Vilkyškių evangelikų liuteronų bažnyčios įsikūrimo data nėra tiksliai žinoma. Skirtingi autoriai nurodo 1549, 1561 ar 1562 metus. Vilkyškių bažnyčiai teko susidurti su daugeliu niokojimų: 1662 metais įsiveržę švedai, nenurimstantys žemaičių antpuoliai, 1668 metais užplūdęs maras, svetimų kareivių atakos, 1757 metais prasidėjęs Septynerių metų karas, kazokai, nužudę pirmąjį parapijos kunigą Johanną Schwennerį ir nusiaubę pačią parapiją bei dvarus bei sodybas.
Bažnyčia buvo pradėta atstatyti 1771 ir tik po gero šimtmečio, 1896 metais, įgavo prieš Pirmąjį pasaulinį karą turėtą išvaizdą.
Daugiau apie bažnyčios ir Vilkyškių parapijos istoriją rasite https://www.liuteronai.lt/Parapijos/Vilkyskiu-parapija/Parapijos-istorija/Parapijos-istorija
